Dúvida sobre IRS

Boa tarde, a datar do momento em que o total de rendimentos seja superior a 12 500€, deixam de se verificar os pressupostos de dispensa de retenção o que significa que a partir do mês seguinte, a ultrapassar esses 12 500€, as faturas emitidas a sujeitos passivos que possuam contabilidade organizada passam a estar sujeitas a retenção na fonte, devendo os seus clientes entregar o imposto ao estado. Contudo não tendo o senhor comunicado essa alteração nas suas faturas e essa retenção não tendo sido feita, muito provavelmente estará uma coima para chegar assim como terá de regularizar o imposto não retido, outra questão que se levanta é relativamente a quem irá ser imposta essa coima uma vez que nos casos de retenção na fonte os sujeitos passivos que devem efetuar a retenção substituem-se ao originário do rendimento (neste caso o senhor), o que significa que nestes casos são de certa forma responsáveis pela não entrega do imposto.
Relativamente, ao preenchimento da modelo 3 do irs teria sempre de a efetuar quer ultrapasse os 12 500€ ou não.