Compra de mercadorias outros mercados.

Bom dia,
Tenho um cliente que compra mercadoria no Equador, essa mercadoria é despachada por um transportador Colombiano (avião), até Madrid. E depois é feito o transporte de Madrid para Portugal por outro transportador Espanhol. Contudo nenhum destes despachantes apresente IL, nem aparece qualquer tipo de informação no Portal Aduaneiro. Apenas o transportador Espanhol apresenta um documento parecido com o IL.
A minha questão é deveria deduzir e liquidar IVA na fatura do Fornecedor de mercadoria do Equador e fazer o mesmo com a fatura do transportador Colombiano visto não ter IL?