Pagamento de Subsidio de Férias

Gostaria de obter a vossa ajuda para a seguinte questão :

-Tinha o maior período de férias marcado para o mês de Setembro, mas tal não veio acontecer por me encontar
com baixa médica, mas a empresa não me processou o o subsidio, que seria apenas de 50% já que
apesar de ainda me encontrar de baixa, continua a processar os respetivos duocicimos(Ferias+Natal).

Pergunto quem tem a responsabilidade de efectuar o pagamento ?

Grato pela vossa ajuda
AF