Fatura c/ Iva autoliquidação indevidamente

Tenho um cliente (SP misto) que recebeu uma fatura com IVA autoliquidação. Como o prestador não possui alvará a fatura deveria ser emitida com IVA. A fatura diz respeito ao terceiro trimestre de 2026. Vou pedir a nota de crédito mas está só será emitida no quarto trimestre. Portanto terei de lançar a fatura. O problema é que esta fatura é referente a um artigo que não confere direito a dedução. Pretendo lançar a fatura normalmente com IVA autoliquidação e depois como proceder para regularizar já que este não tem direito a deduzir o imposto?

Agradeço a colaboração!

Desde Julho existem novas instruções para resolver este problema, e dependendo do software de gestão pode já poder fazer de acordo com as novas instruções.

https://info.portaldasfinancas.gov.pt/pt/atualidades/instrucoesadmin/Paginas/Oficio-circulado-25120-2026.aspx