Inspeção segurança social

Boa tarde Colega,

Um cliente nosso foi alvo de inspeção por parte da segurança social, pois o sócio gerente nunca quis processar subsidio de férias e de Natal aos funcionários.

Agora a segurança social está a exigir o processamento dos mesmos desde 2013 ate 2015.

Já algum colega passou por esta situação?
Estava a pensar processar agora em 2017 um recibo com os retroativos e declaração na ss com os meses corretos, e na DRM AT como referente a períodos anterior, mas estou com medo que depois gere divergências no IRS dos trabalhador dos anos anteriores.

Agradeço a vossa opinião relativamente a esta situação e à melhor forma de resolução.

Melhores cumprimentos,