Bom dia,
O ideal é a reconciliação ser feita algumas vezes durante o mês, não só no final do mês, especialmente depois de vários movimentos.
O método que utilizava era ter um excel com todos os movimentos de caixa, movimentos de entrada, saída, descrição, valor etc. Tens o saldo inicial do mês, os movimentos do período e o saldo final terá de ser o valor em caixa.
Depois tens outro excel com a listagem das moedas e de notas, à frente inseres a quantidade que tens para cada uma das moedas e notas e quantidade vezes o valor da moeda tem de te dar o valor que tens em caixa. Aqui podes também trabalhar com saldo inicial e saldo final do período.
Ambas as folhas de excel terão sempre de cruzar uma com outra.