A junta vai passar uma declaração que agora (e não em 2016) estão unidos de facto...
Se declararem despesas da residência errada pode acontecer várias coisas, uma é o facto ser detectado aquando a AT processa a declaração (e aí há um processo de divergências), ou pode, durante a entrega da declaração o site mostrar um aviso (e se continuar ignorando o aviso quase de certeza que haverá um processo de divergências).
Num processo de divergências ou justifica a divergência no site ou utiliza o botão entregar declaração no consultar divergência (que até agora substituir assim a declaração não dá multa), se deixarem andar sem fazer nada vão receber uma carta para mostrar as despesas.
Outra coisa é eles serem chamados para uma inspecção, aí a AT vai fazer uma declaração oficiosa aonde além de cobrar o imposto, cobra multas, juros, despesas, etc... (as chatices e os valores podem ser bastante diminuídos se o "fiscal" sugerir que substituam a declaração e vocês substituírem a declaração, coisa que vocês não tem que fazer).