Processamento de salário de funcionário que esteve com baixa pelo seguro

Bom dia, necessito da vossa ajuda.
Tenho um funcionário que este mês esteve de baixa médica pela companhia de seguro (após acidente de trabalho) do dia 10(2ª feira) e teve alta dia 14(6ª feira), compareceu ao trabalho no dia 17.
Agora a minha dúvida é se tenho de contabilizar para efeitos de remuneração o dia 15 e 16 ou se contabilizo apenas a partir do dia 17.
Aguardo a vossa melhor ajuda.
Obrigada e votos de boas festas.