Declaração Mensal de Remunerações

Verifiquei que as DMRs entregues nos meses de janeiro, fevereiro e março seguiram com o IRS duplicado. Neste momento, vou substituir as declarações. Relativamente ao valor pago em excesso pela entidade, como é que a AT processa o crédito? Existe alguma opção para solicitar que o acerto seja feito nas próximas declarações?