Bom dia,
Também passei por essa situação e consegui resolver o que tem de fazer é o seguinte:
1º - Vai a contabilidade-Utilitários-Investimentos-Histórico das depreciações
Aqui coloca o código do investimento e clica em Chift+delete e elimina todas as depreciações efetuadas.
2º Depois vai novamente à ficha de investimento e elimina o bem
3º Abre outra ficha de investimento com o mesmo número e com a alteração que quer fazer neste caso o valor das depreciações acumuladas.
Se precisar de alguma ajuda diga-me por favor.
Marcelo Ribeiro