Factura isenta de Iva anulada por erro

Boa Noite, tenho uma questão que sinceramente não faço a mínima ideia como solucionar. A empresa onde estou(com Iva trimestral) e passa uma factura à empresa B (com Iva mensal) isenta de IVA sob o Artigo 53 do CIVA,em 15 de Março de 2014. A 8 de Abril de 2014 a administrativa anula a factura por engano. Tentou a devolução da factura por parte do cliente,para emitir nova factura, mas foi impossível visto o IVA do cliente ser mensal e já ter entrado na contabilidade.
Alguém sabe como solucionar?

P.S.-O sistema de facturação é o Sage, já se tentou reverter a situação, mas legalmente já não é possivel.

Julgo que pode ser uma opção viável, emitir uma nova fatura com a seguinte indicação: "Substitui a FT 2".

Assim, na contabilidade da empresa emitente, só vai existir uma fatura. Na contabilidade da empresa cliente, eles apenas anexam a nova FT à FT anterior.

Não entendo como é que uma empresa emite faturas isentas ao abrigo do artigo 53º do CIVA
Deve haver aí algum engano no artigo.

Boa Noite, tenho uma questão que sinceramente não faço a mínima ideia como solucionar. A empresa onde estou(com Iva trimestral) e passa uma factura à empresa B (com Iva mensal) isenta de IVA sob o Artigo 53 do CIVA,em 15 de Março de 2014. A 8 de Abril de 2014 a administrativa anula a factura por engano. Tentou a devolução da factura por parte do cliente,para emitir nova factura, mas foi impossível visto o IVA do cliente ser mensal e já ter entrado na contabilidade.
Alguém sabe como solucionar?

P.S.-O sistema de facturação é o Sage, já se tentou reverter a situação, mas legalmente já não é possivel.