método utilizado no processamento de salários

Boa noite,

Eu trabalho numa empresa, em que uma das minhas funções é ajudar no processamento de salários de cerca de 60 funcionários.
A minha experiência profissional é muito curta e apenas conheço esta empresa.
Acontece que todos os mês detectamos alguma falha já dps de pagos os salários e por vezes até depois do dia 10 do mês seguinte e pelo que minha colega comenta sempre foi assim.
Na minha opinião é o mecanismo que é utilizado na empresa que provavelmente não é o mais adequado.
Passo a explicar por alto o mecanismo utilizado:

            -> É tirado o ponto do programa e é vista as horas, faltas, férias, se há subsídios a pagar ou outro extra.
            -> outra pessoa vai conferir se as horas foram bem contadas.
            -> é inserido esses dados numa folha de excel pré definida que faz as contas como o programa
            -> num outro livro de excel é criada uma folha onde são introduzidas todas as faltas, outra folha onde são introduzidas as horas extra, outra para sub alimentação, outra para sub turno , outra paar sub natal...
            -> são introduzidas as variáveis no programa através da 1º folha de exel
            -> são conferidas as variais do programa com 2 segundo livro de excel criado.
           

Parece-me que a empresa tem montes de trabalho e não é eficiente.

Gostava que partilhassem o método que vocês utilizam a fim de pode tirar ideia e tentar adaptar a empresa onde estou.

Obrigada    

O meu exemplo, não resultará em empresas com tantos funcionários, mas aqui vai:

A responsável pelo pessoal do hotel, conta as horas trabalhadas a mais, e os feriados e/ou folgas trabalhadas e escreve no word (como se fosse uma comunicação interna).

A pessoa que processa, faz as contas dos valores base e assinala na mesma folha. Depois insere no Primavera em alterações mensais, o valor base. Depois o programa faz o resto.

Obrigada colega.