Estando de baixa pode se processar ao funcionário sub ferias sem perda da mesma

Bom dia colegas
Se um funcionário se encontrar de baixa à mais de 30 dias, pode a empresa processar o respectivo sub de ferias? Fazendo isso o funcionário não irá perder a baixa ( neste caso a segurança social pagará na mesma a baixa, mesmo tendo a empresa processado o sub ferias referentes ao ano anterior? )