Bom dia,
Este tópico esta na área "Fiscalidade" relativa as licenciaturas, ficando a dúvida se é exercício académico ou não (nesta área deve ser objecto de debate apenas as matérias de índole académica).
A sua questão em concreto, se está a vender ou a prestar um serviço, passará então um documento de venda ao cliente final, esse documento será pela totalidade do serviço ou produto disponibilizad o! Se for um comissionista, ai de facto só passa factura da comissão, sendo que esta seria passada ao fornecedor e não ao cliente final!
Espero ter ajudado!
Cumprimentos
Paulo Carvalho