Factura + Nota credito construção civil (com o erro de inclusão de IVA)

Colegas como procedem neste caso:

Fornecedor prestou um serviço de construção civil (obra) ao meu cliente empresa SP de IVA.

Em Outubro o fornecedor emitiu factura nº1  de 2500+ IVA referente ao fornecimento de materiais,e posteriormente a factura nº 2 do serviço com IVA Autoliquidação.

Alertei o meu cliente que o valor global de factura, independentemente de haver ou não discriminação dos vários itens e da facturação ser conjunta ou separada, é abrangido pela regra de inversão de sujeito passivo -"IVA autoliquidação"

O fornecedor não anulou em Outubro a factura nº1, e emitiu em Novembro Nota de crédito de 2500+IVA, e procedeu também em Novembro à emissão da factura correcta de 2500,00 "IVA autoliquidação".

Ocorrendo tudo neste 4º trimestre de IVA, ainda não foi enviada a declaração qual o tratamento contabilístico que davam à factura nº1 e nota de credito,  campos na D.IVA.

Obrigada