Adiantamento de Cliente com iva

Boa tarde
Uma empresa recebeu um adiantamento de cliente em Maio e só fez a fatura e recibo  agora em 31 Julho, apesar dos meus alertas...
Como o adiantamento tem iva, a minha duvida é se devo fazer um documento interno e entregar o respectivo iva nesta declaração IVA do 2 Trimestre, ou só fazer o registo desse iva em julho com a fatura e ficará em aberto uma possível coima desde Maio a Julho, havendo fiscalização. Podem ajudar? Muito obrigada