Bom dia,
Terá de entregar uma declaração de alterações e introduzir a atividade secundária a partir da data pretendida, com o respetivo código (não sei se no seu caso será o 1320 Consultores, da tabela do 151º CIRS).
Do meu entendimento, quer dizer isso mesmo: o código da atividade principal será a que é desenvolvida como "principal", da qual teoricamente deverá obter mais rendimento; a secundária, menos desenvolvidaq. ..(salvo melhores opiniões/explicações).