Quanto a impostos não há nada a acrescentar.
Quanto a contabilidade depende do valor, se for um valor muito grande numa empresa de NCRF tens que refazer as demonstrações financeiras, se for um valor moderado tens que fazer um novo anexo para esses anos (datado de agora) e descreveres essas facturas nos acontecimentos após a data de balanço, se for um valor imaterial lanças na conta 6881 - Correcções de exercícios anteriores e esqueces.
Pode-me estar a escapar algo, lê a ncrf dos erros.
E não esqueças de ver o IES, não o conheço de cor, mas tirado os casos de valores insignificante s tens que o substituir