Boas,
Não fui procurar na legislação, mas por analogia terá toda a lógica a Guia de Transporte pelas razões que já indicaram entretanto.
Está no seu local de venda. Logo o que ele faz é transportar mercadorias entre o armazém e as suas lojas. Depois tem a parte em que não transporta sempre a mesma quantidade que consta da factura pelo que deverá em cada viagem fazer uma nova guia de transporte.
A factura de compra, está nos escritórios centrais ou na contabilista. Ou ainda nem chegou!!!
A menos que exista alguma legislação específica que refira diferente, penso que deverá ser assim. Nem me parece que exista alguma lógica não o ser.