Caro colega,
As taxas apresentadas nas tabelas de RF são as taxas mínimas. Ou seja, não pode aplicar uma taxa menor do que vem na tabela, de acordo com os dados dos colaboradores.
Mas caso, o colaborador expressa a vontade de reter a uma taxa superior (porque costuma pagar muito IRS, por exemplo...), a empresa pode fazer isso.
Espero ter ajudado.