Vamos por partes.
A retenção na fonte não é para ir na factura, é para ir no recibo, já que o momento da retenção é o recebimento ou colocação à disposição (CIRS101 nº8), sem prejuízo de poder ser colocada na factura apenas como uma mera indicação.
Só que a construção civil está na alínea F, do número 1 do artigo 4, e portanto não é prestação de serviços, é actividade comercial e industrial, englobada pela alínea A, do número 1 do artigo 3º, pelo que não há retenção na fonte porque o artigo 101 não menciona directamente ou indirectamente esta alínea 1 do artigo 3º.
Confira sff as alíneas porque estou a falar de "cor".